在《过山车大亨3：野生动物园》中，你将可以购买大批动物，建设特定的生态环境，举办动物表演。本作的动物分为六种类型，包括常见的老虎、狮子、猩猩、大象等，他们在动物园中都有各自的居住环境。除了要为动物们建造适合的生态环境外，你还要安排训练员帮忙饲养以及清洁动物。每只动物都有饥饿、口渴、健康、快乐等状态值。你要认真照顾动物才能让他们开心。如果虐待或者忽略动物，动物保护协会就会把他们带走。你还可以为动物购买各种玩具和他们玩耍。
你可以通过《过山车大亨3》的“MixMaster”功能设计一出狮子表演，例如跳火圈、走球、将训练员的头放到狮子的嘴里等等。游戏中还有很多动物主题的过山车，你可以让游客坐在大象的背上。你还可以驾驶SUV带着乘客到野生生态区观光。不过多数动物都是关在笼子里的，可以挑选的栅栏也有很多种。例如瞪羚跳得很高，因此要为其准备很高的栅栏。如果你为动物准备的生态环境不适合其居住，动物们就会逃脱。这时候你需要使用镇静剂。这时候你会坐在直升机上，像用狙击枪一样放大镜头朝动物设计镇静剂。

本作共有18条过山车道和8种过山车，全部根据现实世界制作，例如新加入的“地震”过山车以及来自欧洲的G-Force过山车。本作还加入了“动物镜头”的概念，让你可以通过动物的眼睛观察动物园。